Chociaż nazwa sugeruje obecność pełnego zespołu, Sparklehorse była w zasadzie twórczością wokalisty i autora tekstów Marka Linkousa, byłego członka indie bandu Dancing Hoods z lat 80. Następnie przez pewien czas był członkiem zespołu Johnson Family (później znanej jako Salt Chuck Mary), a także pracował jako kominiarz i malował domy. W 1995 roku zaczął tworzyć pod pseudonimem Sparklehorse, doskonaląc swój nastrojowy, lo-fi pop w studiu na jego farmie w Bremo Bluff w stanie Virginia. Po tym jak demo dotarło do biur Capitol Records, Linkous podpisał kontrakt z wytwórnią i wydał debiutancki album Sparklehorse, Vivadixiesubmarinetransmissionplot, odnosząc sukces w alternatywnym radiu z singlem "Someday I Will Treat You Good."
Na początku 1996 roku, po koncercie Sparklehorse w Londynie, Linkous prawie stracił życie, po zażyciu Valium razem z przepisanymi antydepresantami. Spędził 14 godzin nieprzytomny na podłodze łazienki hotelowej, z nogami przygniecionymi przez resztę ciała. Utrata krążenia przez tak długi czas niemal sparaliżowała go. Wiele miesięcy i niezliczonych operacji później, dosłownie stanął na nogi, a jego powrót do zdrowia stał się inspiracją dla albumu z 1998 roku, Good Morning Spider. Później współpracował z PJ Harvey oraz Niną Persson z The Cardigans nad albumem z 2001 roku, It's a Wonderful Life.
Następny projekt Sparklehorse był naprawdę ambitny: multimedialna galeria dźwięku i sztuki, zrealizowana we współpracy z Danger Mouse'em i filmowcem Davidem Lynchem pod nazwą Dark Night of the Soul. Mimo że miał zostać wydany w 2009 roku przez Capitol, album znalazł się w centrum sporu prawnego między EMI a Danger Mouse'em. Linkous skupił się zatem na współpracy z Christianem Fenneszem, z którym wcześniej nagrywał w 2007 roku. Fragmenty tych sesji zostały zebrane razem, tworząc wydanie z 2009 roku, In the Fishtank.
Na początku 2010 roku Linkous przeprowadził się do Hayesville w Karolinie Północnej i był blisko ukończenia nowego albumu Sparklehorse. 6 marca tego roku, będąc u przyjaciół w Knoxville w stanie Tennessee, popełnił samobójstwo w wieku 47 lat. Wyrazy współczucia napłynęły od wielu znanych artystów, w tym Patti Smith, Steve'a Albiniego i Stevena Drozda z The Flaming Lips. Oficjalne wydanie Dark Night of the Soul pojawiło się w lipcu tego roku.
Opracowania na podstawie: allmusic.com